Ngày 6/8/2018, Ủy ban nhân dân thành phố Hà Nội đã ban hành Quyết định 4016/QĐ-UBND về việc thành lập Trung tâm Kiểm soát bệnh tật thành phố Hà Nội trên cơ sở tổ chức lại trung tâm Y tế dự phòng Hà Nội.
Cơ sở cơ sở 1 của Trung tâm Kiểm soát bệnh tật nằm tại số 70 Nguyễn Chí Thanh, Đống Đa, Hà Nội.
Cơ sở 2 nằm ở Khu Hành chính mới quận Hà Đông, Hà Nội.
Cơ sở 3 nằm ở số 1 ngõ 2 Quang Trung, Hà Đông, Hà Nội.
Trung tâm này có chức năng sau:
- Tham mưu, thực hiên các hoạt động chuyên môn, kỹ thuật, nghiệp vụ về phòng, chống dịch bệnh truyền nhiễm; bệnh không lây nhiễm;
- Tham mưu cho Giám đốc Sở Y tế vận động các cá nhân, tổ chức tài trợ, hỗ trợ phòng, chống dịch bệnh nguy hiểm trên địa bàn thành phố.